Отдел аспирантуры ОшГУ был открыт 22 августа 1991 года приказом министерства народного образования Кыргызской ССР №399/1. С того времени руководителями отдела были доктор физико-математических наук, профессор К.О. Осмоналиев, кандидат филологических наук, доцент С.А. Мамытов, кандидат философских наук, доцент Ж.М. Сулайманов. С октября 2000 года была создана структура отдела науки и аспирантуры, руководителями которой работали кандидат филологических наук, доцент Сабирова В.К., кандидат физико-математических наук, доцент Өскөнбаев М.Ч., старший преподаватель Садырова М.М., кандидат психологических наук, доцент Закиров А.З., кандидат физико-математических наук, доцент Анарбаева Г.М.

      Миссия отдела – подготовка квалифицированных исследователей по различным направлениям, соответствующих международным стандартам и требованиям современной науки, способных самостоятельно проводить научные исследования. Основной целью деятельности отдела аспирантуры и докторантуры является подготовка высококвалифицированных научных и научно-педагогических кадров в соответствии с миссией и стратегическими целями ОшГУ, с интеграцией в международное научное пространство.

      Задачами отдела являются привлечение аспирантов и докторантов к научной деятельности, формирование у них соответствующих общепрофессиональных, управленческих, культурных и социальных компетенций, обмен мнениями по вопросам научных исследований в фундаментальных и прикладных областях, привлечение их к участию в научных дискуссиях, развитие навыков выражения и защиты собственных научных взглядов, а также повышение их способности работать с зарубежными грантами.

Отдел включает следующие структуры: аспирантура, докторантура PhD и соискательство .

       С момента открытия аспирантуры более 800 из свыше 1000 её выпускников успешно защитили кандидатские диссертации.

       Следует особо отметить плодотворную деятельность кандидата физико-математических наук, доцента Г.М. Анарбаевой, которая на протяжении многих лет успешно руководит отделом науки и аспирантуры, в деле подготовки научно-педагогических кадров.

       Благодаря её активной деятельности в 2022 году аспирантуре ОшГУ была выдана лицензия Министерством образования и науки Кыргызской Республики по 101 специальности в рамках 15 направлений (в 2025 году дополнительно были открыты ещё 2 специальности). Таким образом, ОшГУ стал одним из первых вузов Кыргызстана, получивших подобную лицензию.

      С 2014 года доцент Г.М. Анарбаева непрерывно и успешно организует, и проводит ставшие традиционными для университета региональную и международную студенческую научную конференцию под названием «Студент и научно-технический прогресс».

      Главным специалистом Анарбаевой Г.М. также ведётся работа по приведению документации аспирантуры в соответствие с новыми нормативно-правовыми актами. В частности, были разработаны и утверждены на Учёном совете «Положение об аспирантуре ОшГУ», учебные планы, сертификат об окончании аспирантуры и другие документы.

      В настоящее время в аспирантуре Ошского государственного университета обучаются и занимаются научно-исследовательской деятельностью около 300 аспирантов. На данный момент в университете научное руководство аспирантами осуществляют 115 учёных, из них 110 — доктора наук, профессора, и 5 – кандидаты наук, доценты. В ОшГУ научное руководство аспирантами ведут 45 докторов наук, профессоров и 2 кандидата наук, доцента. Из других вузов и научных учреждений подготовкой научных кадров занимаются 65 докторов наук, профессоров и 3 кандидата наук, доцента. Среди них имеются известные учёные, академики и члены-корреспонденты НАН КР.

       Одним из направлений деятельности является регулярное проведение международных, республиканских и региональных конференций, тренинг-семинаров и круглых столов. Наряду с этим для аспирантов, соискателей и молодых исследователей ежегодно на базе оздоровительного центра ОшГУ «Ак-Буура» организуется цикл трёхдневных летних тренинг-семинаров Школы молодых учёных по таким темам, как: «Основы научных исследований», «Методология научно-исследовательской работы», «Новые критерии оценки научной деятельности», «Публикация научных трудов в системах Web of Science и Scopus» и др.

      Вместе с этим осуществляется организация, проведение, контроль и координация студенческой научно-исследовательской деятельности.

       С 2014 года отделом аспирантуры университета регулярно и успешно проводится региональная научно-практическая конференция «Студент и научно-технический прогресс», а с 2025 года – международная научно-практическая конференция под тем же названием. Материалы конференций публикуются в специальных выпусках научного журнала «Вестник ОшГУ».

      Деятельность аспирантуры осуществляется в рамках реализации перспективных направлений развития научной деятельности, предусмотренных «Программой стратегического развития Ошского государственного университета как модели устойчивого развития на 2023-2026 годы», а также направлена на интеграцию в международное научное пространство посредством целенаправленной и комплексной системы мероприятий.

      Обучение в аспирантуре осуществляется по очной и заочной формам, а в докторантуре PhD – по очной форме, при этом допускается также использование дистанционных технологий. Срок обучения по образовательной программе аспирантуры составляет 3-4 года, а продолжительность профильной базовой докторантуры PhD – не менее 3 года.

      Преподаватели и исследователи имеют возможность выезжать в 33 высших учебных заведения из 10 государств, с которыми университет заключил соглашения о сотрудничестве, для обучения, прохождения краткосрочных и долгосрочных научно-исследовательских стажировок, а также научно-педагогической практики.

      Аспирантура и соискательство осуществляют приём по 103 специальностям в рамках 15 научных направлений. В свою очередь, докторантура PhD ведёт деятельность по 11 направлениям. В настоящее время более 114 докторантов PhD обучаются и занимаются научно-исследовательской деятельностью.

      Деятельность соискателей учёной степени доктора наук в Ошском государственном университете осуществляется с 2018 года на основании «Положения о подготовке научно-педагогических и научных кадров в Кыргызской Республике» (в настоящее время утратившего силу), утверждённого постановлением Правительства Кыргызской Республики № 327 от 16 июля 2018 года, а впоследствии – на основании постановления № 358 от 4 июля 2024 года .

       Деятельность соискателей учёной степени доктора наук в Ошском государственном университете осуществляется с 2018 года на основании «Положения о подготовке научно-педагогических и научных кадров в Кыргызской Республике» (в настоящее время утратившего силу), утверждённого постановлением Правительства Кыргызской Республики № 327 от 16 июля 2018 года, а впоследствии – на основании «Положения о подготовке научных и научно-педагогических кадров по программам послевузовского профессионального образования», утверждённого постановлением № 358 от 4 июля 2024 года.

      Согласно вышеуказанному Положению, с 2019 года документы для соискания учёной степени доктора наук принимаются на конкурсной основе один раз в год (февраль-март). С 2024 года приём осуществляется ежегодно в период с 10 июля по 10 октября. Для этого отдел аспирантуры и докторантуры размещает соответствующее объявление на сайте университета. Конкурсная комиссия, сформированная из ведущих учёных вуза, рассматривает документы кандидатов по специальностям, имеющим лицензию в рамках программы подготовки аспирантов университета, после чего решением Учёного совета соискатели прикрепляются к соответствующим кафедрам сроком на 4 года. Темы утверждённых докторских диссертаций вместе с копией протокола размещаются в реестре Высшей аттестационной комиссии Кыргызской Республики.

       Соискатели самостоятельно работают над своими научными темами. Допускается утверждение тем докторских диссертаций и без научного консультанта. Соискатели ежегодно представляют годовые научные отчёты на соответствующие кафедры, к которым они прикреплены, а также в Научно-технический совет ОшГУ.

       Решением очередного заседания Учёного совета № 6 от 9 апреля 2025 года (приказ № 1867-ФХД/25) в ОшГУ был открыт институт соискательства на соискание учёной степени кандидата наук, и на 2025-2026 учебный год были приняты 20 соискателей (на соискание ученой степени кандидата наук).

       С 2019 года общее количество соискателей самостоятельно работающих над докторскими диссертациями в ОшГУ составляет – 132. А количество на соискание учёной степени кандидата наук – 20.