Институт естествознания, физического воспитания, туризма и аграрных технологий системно и целенаправленно осуществляет деятельность по развитию международного сотрудничества с зарубежными высшими учебными заведениями и научными организациями. Установленные партнёрские связи способствуют внедрению передовых образовательных технологий и международного опыта в учебный и научно-исследовательский процессы.

В рамках международного сотрудничества Институт поддерживает устойчивые взаимосвязи с партнёрскими высшими учебными заведениями и научными учреждениями. Заключены соглашения о сотрудничестве с рядом зарубежных университетов и научных организаций, в том числе с Андижанским государственным университетом имени Бабура (2017), Худжандским государственным университетом имени Гафурова (2018), Поморской академией (Польша, 2018), Московской государственной академией ветеринарной медицины и биотехнологии (2019), Чирчикским государственным педагогическим институтом (2019), Самаркандским институтом ветеринарной медицины (2020), Кокандским государственным педагогическим институтом (2020), Научно-исследовательским институтом животноводства и птицеводства г. Ташкента (2021), Ташкентским государственным аграрным университетом (2021), Андижанским институтом сельского хозяйства и агротехнологий (2021) и другими.

В последние годы значительно активизировалось научно-исследовательское сотрудничество кафедр Института с зарубежными университетами и международными организациями. Это подтверждается академической мобильностью профессорско-преподавательского состава, а также рабочими визитами представителей зарубежных партнёров в Институт.

Институт активно участвует в реализации международных грантовых проектов и привлечении инвестиций. В частности, в рамках программы Европейского Союза Erasmus+ реализован ряд международных проектов, а также осуществлены научные исследования при поддержке Швейцарского агентства по развитию и сотрудничеству (SDC), что свидетельствует о высоком международном научном потенциале Института.

Кроме того, с 2022 года Институт реализует программу двойного диплома по направлению «Ветеринария» совместно с Самаркандским институтом ветеринарной медицины.